云计算、大数据延伸至生命信息领域:生物云计算_CIO频道

  跟随互联网广播网的普及和技术的开展,大datum的复数和云计算先前浸透在普通百姓的的继续存在的每个担任守队队员,在银行事情,转述,动力,交通等担任外场员得到了射程广泛的的服用。。和生物通信,DNA生物,生殖细胞的细胞质序列,生物芯片,如生物芯片,发生的新datum的复数;比如,DNA测序可以发生每年约150千兆音节(PB)的datum的复数,假定这些datum的复数记忆在DVD中,于是,DVD可以是英里每小时。。生命科学的datum的复数寻求来源和版式的多样性,包含生殖细胞的细胞质测序、分子大道、形形色色的的人等。全部临床试验必要数万世的统计datum的复数,每个DNA测序范本所发生的datum的复数都是用MEG计算的。、迅速应用这些大datum的复数,毫无疑问,在这么担任外场员将有无法计量的的机遇。,但方式辨析和使用它也拿来了新的挑动。。生物云计算便能终止的处置这些成绩;

  1)云记忆:应用世上数以百计的侍者,经过传播计算零碎,达到贱的、附近的的的保养;

  2)云计算和大datum的复数辨析:大型材datum的复数尼康的多相将是复杂的。,枯燥无味的datum的复数形象,使单纯方式装备了辨析的总算。。

  大datum的复数,云计算,生物医学——三个炙手可热的保留字和有派遣的会是什么成功获得的事?从服用角度动身,这可以是SaaS,可以是PaaS;下面引见相当中外的生物云计算公司,从第四担任守队队员来要点引见一下在云涌现的比较地举足轻重的在云海生物大datum的复数的服用。这第四担任守队队员分可能生殖细胞的细胞质测序。,临床药物背诵与利用设法对予以安康设法对付

  1) DNAnexus

  DNAnexus 这是第一往出示云的户。 DNA datum的复数库的风险公司,并向背诵人员和科学家预备这些datum的复数。。其派遣是在云中贮存更多的生殖细胞的细胞质。,生殖细胞的细胞质的附近的获取与比较地辨析。该发射还预备了人类遗传datum的复数的伴奏的。,生殖细胞的细胞质检索与社团。经过检索和社团,修改可以找到对数百万病人无效的药物。。眼前 DNAnexus 用户包含大学校舍和大学校舍,如斯坦福大学校舍,一批备用药品公司,相当修改将经过DNA。 不健康诊断通信。该公司预备的保养针对处置洛杉矶的成绩。,人类生殖细胞的细胞质测的第一datum的复数,原始datum的复数在100克到600克暗中。,经过保养导入到云保养平台,后头预备了充分活泼的多样化的各类各样的上datum的复数的测序辨析和比对的派遣工艺流程,datum的复数可以无效地设法对付,测序总算可以终止地以胶粘的版式显示浮现。。该公司从谷歌达到了1500百万抵制的融资。。2014年1月,谷歌生殖细胞的细胞质组翻开了生殖细胞的细胞质组云记忆保养,谷歌的生殖细胞的细胞质记忆datum的复数的本钱是年纪25抵制100GBdatum的复数。,古怪的生殖细胞的细胞质原始通信的记忆。并对谷歌的特别算法举行了处置。,可紧缩到1GB,费也将降到25一分钱的硬币。。

  2)七 Bridges Genomics

  SevenBridges 生殖细胞的细胞质组学是一家美国风险公司。,首要生殖细胞的细胞质测序与生物一批备用药品产额保养,生物通信形象,datum的复数辨析及其余的担任守队队员。Seven Bridges Genomics在人类生殖细胞的细胞质组排序和辨析中并联服用了云计算和NoSQLdatum的复数的技术,比如,EC2、S3和MongoDB。为了节食datum的复数记忆的本钱,他们也应用冰河。。Seven Bridges PaaS预备了第一交流来体格datum的复数大道,这些大道可以本预订义的用模子做。,它也可以比照流行的派遣举行调节器。。

  3)弩

  弩是一种可以用于全生殖细胞的细胞质组重行排序辨析的器。。经过各自的类库的集成,它可以借助AWS只花不到100抵制的本钱在3小时带着辨析完第一人类生殖细胞的细胞质组。到某种状态对生物通信学感兴趣的利用者应用程式,这是第一终止的器。。这是第一全生殖细胞的细胞质辨析的顺序软件。,它的意思依赖高音部的开展。,在一台侍者上使完满第一人的安康辨析,该软件先前减少的工夫经过亚马逊的云平台hodoo。总算风景,现今是紧缩少于3小时的32cpu中心。,总本钱不到100抵制。,这是很多派遣的偏袒地。。

  4)Explorys

  Explorys找到于2009,是一家临床医学datum的复数设法对付服用公司。,这是一家因为克利夫兰诊所的举行开幕典礼型公司。。公司使用大datum的复数增多麦克匪特斯氏疗法平均的和保养质量。。公司经过最权力大的的修改衔接每个零碎的datum的复数。,预备直接地的临床一致性、高危兽群设法对付、卫生防护计算处置编程序和机能处置编程序。该平台有2050亿个临床试验。、财务、运转datum的复数元素,盖3800万例、300养老院、215,000多家麦克匪特斯氏疗法保养预备者。18家大型材并联麦克匪特斯氏疗法零碎在应用塌实的Explorys云计算平台决定不健康的典型、对待编程序与疗效。它本公有云用模子做。,向第三方薄纸预备保养,第三方薄纸可以获得他们的临床datum的复数。、开刀和进行辩护datum的复数的财务datum的复数安置在这么P上。,该平台为实时datum的复数辨析预备了最大的好的。,1300万人的显得庞大,大概4400亿的物质,datum的复数的显得庞大大概是60 TB。,70杆菌性痨病2013,最下面的河床技术在hodoop。

  5)公司

  Illumina公司是在遗传异型和生物担任外场员的第一纤细的的产额、技术和保养预备商。Illumina公司交易形势射程射程广泛的的DNA相互关系产额,包含生殖细胞的细胞质测序为演奏谱曲、用于辨析相互关系datum的复数的软件和保养。经过帮忙客户放慢获得生物通信的收集、辨析和服用,改革人体安康。流行的,Illumina公司已占交易70%的生殖细胞的细胞质组测序。该公司本年正找到。,Illumina公司先前预告了每一新的高端生殖细胞的细胞质顺序分析仪,直接地的生殖细胞的细胞质组序列可以正确无误的测。,费不到1000抵制。。流行的,生殖细胞的细胞质组测序不再是第一复杂的背诵器。,读取承认人类DNA的本钱先前降到了十足低的平均的。,它甚至可以用来处置相当医学成绩。,决定对待编程序。

  6)弊病云记忆

  2014年9月24日,美国弊病背诵中心上联合会的公报,弊病生殖细胞的细胞质组云计算平台检验发射启动 Broad Institute,Institute for SystemsBiology和Seven Bridges Genomics, Inc.,三重奏分可能700万人。、650百万抵制和580百万抵制。NCI启动本发射时射程广泛的预告 Agency Announcement终止地论述了第一大型材科研机构或科研发射对云计算生物通信零碎在每个担任守队队员的资格,包含中心datum的复数、架构、计算保养、辨析资格、权威设法对付、保障安全的、可延长、datum的复数基准等,方式评价云计算生物通信的根本思索。

  奇纳河生物云计算公司

  在奇纳河,在技术辨析交易,这是生殖细胞的细胞质组学的代表,咱们四周如同仅有的大生殖细胞的细胞质。、诺禾致源、药明康德、Berry和康、明治生物…实则,这么交易比咱们设想的说得来得多。。国际公共云计算保养的成熟的,和AWS的进军奇纳河的步,本云计算的datum的复数辨析,在奇纳河也开端涌现,独有的的小校订者现任的为您独有的引见了国际的形势。:

  1) 华大科学技术

  华大的技术是本第一成熟的的交易云平台和上进的,为客户预备云计算、云记忆和云交付的并联保养。眼前,首要原因是:生物通信学辨析的完全处置编程序(BGI 箱),本云的生物通信学辨析,datum的复数云交予以datum的复数库网站概念。

  2)自豪联姻

  荣合不得不最深受欢送的云计算发射,IT板块是一种生命力。。Rong Ji是承认datum的复数中心处置编程序的承认产额的发射。、营销保养广播网膨胀过程编程序、生物云计算datum的复数中心与首要B顾虑的利用概念发射和其余的使就职。以生物云作为突破口,具有10年在上文中工业界服用感受。,荣选择生物工业界为突破口。生物通信学是一门新兴工业界。,惯例的主张是生物背诵依然在T检验中检验。,实际上,它先前进入分子生物阶段了。,从SE测DNA碱基序列的序列通信。,浓厚的后续派遣根本上是计算图表的派遣。。现今,荣之联正竭力将华大生殖细胞的细胞质概念生物云的感受涂到完全地生物背诵担任外场员。更生物云,荣联仍在概念内阁云。、漫画云等一下,竭力把这些云带到地上的。

  3)羞手羞脚的欢送:

  公司专注于人类外显子测序datum的复数辨析和全生殖细胞的细胞质组。。Illumina人类生殖细胞的细胞质组测序的X 十是本年国际测序修理交易的第一响当当的名字。,全生殖细胞的细胞质组测序datum的复数辨析首要集合在兽群和。外显子序列datum的复数辨析宜仅仅是初始P所做的每一保养。。

  4)保盈科学技术

  聚道科学技术()的创始人李夏戎是中科院自动化所的博士,Ali先于买的联姻,这是该联姻的首座datum的复数科学家。前Ali Yun ODPS的产额理事,王乐恒也接合点了这么合作,太。在接合点阿列伊云先于,王乐恒是中科院计算局的发射理事,零碎。让步互联网广播网加云计算安排的合作杀进生物datum的复数担任外场员,这如同是使就职者的第一使兴奋选择——使就职一百百万抵制。。从它的网站上的演示,他的产量如七 Bridges和DNANexus。

  5) 华为生物云

  华为生物云聚焦国际交易,尤指服装、颜色等相配生殖细胞的细胞质工程、蛋白质工程、生物一批备用药品等必要高机能计算的事情的华为云计算处置编程序这次也为咱们拿来了惊喜。华为云计算处置编程序,经过HPC派遣流、机动性计算云、情郎云记忆、线下datum的复数发送事情的第四切断,为客户预备端到端处置编程序,在奇纳河的科学背诵datum的复数辨析,生物与计算的完美的合并的。

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